A1.仕様です。リンクをクリックして表示されるのは、public_htmlのなかのファイルだけです。

Q2.ドットで始まるフォルダを作成できない

A2.仕様となります。

Q3.編集ボタンを押すと、ファイルが不正と表示される

A3.編集可能ファイルは以下の拡張子のファイルだけです。
php / cgi / log / txt / rb / pl / htm / html / .htpassswd / .htaccess / ini

Q4.64文字以上のファイルやフォルダ名がつくれない

A4.仕様となります。